Trả lời công văn số 97DTW ngày 17/10/2005 của Công ty cổ phần dược trung ương Mediplantex về xử lý hoàn thuế GTGT, Tổng cục Thuế có ý kiến như sau:

Tại điểm 1.2.đ, Mục III, Phần B Thông tư số 120/2003/TT-BTC ngày 12/12/2003 của Bộ Tài chính hướng dẫn thi hành Nghị định số 158/2003/NĐ-CP ngày 10/12/2003 của Chính phủ quy định chi tiết thi hành Luật thuế giá trị gia tăng và Luật sửa đổi, bổ sung một số điều của Luật thuế giá trị gia tăng hướng dẫn: “Các trường hợp có hàng hóa xuất khẩu hoặc được coi như xuất khẩu quy định tại điểm này nếu đã có xác nhận của cơ quan Hải quan (đối với hàng hóa xuất khẩu) nhưng không có đủ các thủ tục, hồ sơ còn lại nêu trên thì cơ sở kinh doanh không phải tính thuế GTGT đầu ra nhưng không được khấu trừ thuế GTGT đầu vào mà tính vào chi phí”.

Công ty có mua hàng hóa, dịch vụ dùng cho hàng hóa xuất khẩu, có hóa đơn giá trị gia tăng hợp pháp, đã nộp thuế giá trị gia tăng đầu vào. Trong khi chờ kết luận chính thức của cơ quan công an, Công ty làm cam kết về việc thực tế có mua hàng hóa, dịch vụ dùng cho hàng xuất khẩu, theo hướng dẫn nêu trên toàn bộ số thuế giá trị gia tăng đầu vào ghi trên hóa đơn của lô hàng xuất khẩu của Công ty được tạm chấp nhận tính vào chi phí. Số thuế giá trị gia tăng đầu vào đã tính vào chi phí sẽ không được xét hoàn thuế.

Đối với số thuế GTGT đầu vào của lô hàng do Công ty cổ phần dược trung ương Mediplantex xuất khẩu bán cho các cơ sở kinh doanh Trung Quốc (mà bị Vụ thuế Quốc tế - Cục thuế Nhà nước, nước CHND Trung Hoa xác nhận là không tồn tại) thì được xử lý theo hướng dẫn tại công văn số 852 TCT/TTr ngày 22/2/2002 của Tổng cục Thuế.

Tổng cục Thuế trả lời để Công ty được biết./.