Trả lời công văn số 882/TCKT-TCT ngày 12 tháng 9 năm 2003 của Tổng công ty xây dựng công trình giao thông 4 (XDCTGT 4) về việc “khấu trừ thuế GTGT đầu vào” của các hoá đơn mua hàng trong thời gian đơn vị làm thủ tục cấp mã số thuế, Tổng cục Thuế có ý kiến như sau:

Tại Tiết 8 Điểm 2, Mục II, phần C Thông tư số 122/2000/TT-BTC ngày 29 tháng 12 năm 2000 của Bộ Tài chính quy đã định việc kê khai thuế GTGT phải nộp đối với các Tổng công ty, Công ty có các cơ sở trực thuộc thực hiện như sau: “các cơ sở hạch toán độc lạp và hạch toán phụ thuộc xác định được thuế GTGT đầu ra và thuế GTGT đầu vào phải kê khai, nộp thuế GTGT tại địa phương nơi cơ sở kinh doanh đóng trụ sở”

Trường hợp của Tổng công ty Xây dựng công trình Giao thông 4, năm 2000 có thành lập thêm đơn vị hạch toán phụ thuộc là Công ty làm thủ tục cấp mã số thuế tại Cục thuế thành phố Hồ Chí Minh, Công ty đã sử dụng mã số thuế của Tổng công ty để mua hàng hoá phục vụ cho sản xuất kinh doanh, sau đó tập hợp các hoá đơn mua hàng chuyển về Tổng công ty để kê khai khấu từ thuế GTGT đầu vào tại Cục thuế Nghệ An thì Tổng công ty có trách nhiệm quản lý, theo dõi và hạch toán số hoá đơn mua hàng hoá này theo chế độ quy định. Khi Công ty công trình giao thông 499 được Cục thuế thành phố Hồ Chí Minh cấp mã số thuế, Tổng công ty xuất hoá đơn GTGT cho Công ty công trình giao thông 499 và kê khai nộp thuế tại Nghệ An, Công ty công trình giao thông 499 nhận hoá đơn và kê khai khấu từ thuế GTGT đầu vào tại thành phố Hồ Chí Minh theo chế độ.

Tổng cục thuế trả lời để Tổng công ty Xây dựng công trình Giao thông 4 được biết và thực hiện.